闽江流经闽侯县内长达73公里，在县内支流发达。今年1~7月水质监控监测统计数据显示，闽江干流闽侯段地表水水质100％达标，但支流水系水质环境仍须提高。
目前，闽侯县已制定出水环境整治规划，主要抓好县城污水处理厂、上街大学新区污水处理厂和青口汽车城污水处理厂建设；重点抓好县城、青口、大湖等垃圾处理焚烧厂（场）建设；12月底前清理关闭全县禁养区内所有养殖场（点），2008年前所有规模化畜禽养殖场必须治理达标排放。
今年初，我市编制并下达了《2007年度闽江流域（福州段）水环境综合整治计划》。全市将根据省里下达的闽江流域水环境综合整治工作任务，计划投资12.39亿元，结合节能减排和我市实际情况，安排40个整治项目，确保闽江流域（福州段）水质功能达标率达95％以上，确保城市集中式饮用水源地水质达到功能要求。
